微波殺菌設備是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變化，使細菌失去營養，繁殖和生存的條件而死亡。微波能使細菌正常生長和穩定遺傳繁殖的核酸RNA和脫氧核糖核酸DNA，是由若干氫鍵松弛，斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體畸變甚至斷裂。相較而言，微波營養粉殺菌系統的特點是：1.時間短、速度快、均勻；2.低溫，產品不易結焦，能保持有效成分；3.設備能耗少，占地小，自動化程度高；微波營養粉殺菌設備流水作業，操作簡單、產量高、殺菌速度快、殺菌均勻、可控性好。可24小時連續工作，微波泄漏量達到國家標準

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