天然種植是將植物直接種植在水體的底泥中，大多數水生植物都是以這種方式種植的。從水體中心到岸邊，根據水深的變化，種植了沉水植物（或漂浮植物）——浮葉植物——挺水植物，形成了高低錯落的風景。漂浮植物需要以封閉的形式固定在某個水域中，以防止它們生長和繁殖太快而覆蓋整個水域。
因為這種種植方法的限制因素主要來自水深的變化，底泥條件，光照強度等，所以只要生長條件合適，水生植物就會通過自我繁殖逐漸占據周圍的空白生長空間。因此，在許多情況下，如果沒有人類的控制，一些水生植物的生長面積將逐漸變化，這將影響甚至破壞水生植物的景觀，
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