1、常規加熱如火焰、熱風、電熱、蒸汽等，都是利用熱傳導的原理將熱量從被加熱物外部傳入內部，逐步使物質中心溫度升高，稱之為外部加熱。要使中心部位達到所需的溫度，需要一定的時間，導熱性較差的物質所需的時間就更長，微波加熱80-100度只需要3-5分鐘，特殊的產品只需要幾十秒就可以超過100度，其它任何方式在幾分鐘內部破壞產品的情況下加熱到這個溫度至少30分鐘以上。 微波干燥殺菌機是使加熱物質本身成為發熱體，稱之為內部加熱方式，不需要熱傳導的過程，內外同時加熱，因此能在短時間內達到加熱速度快的效果。
2、微波加熱殺菌機均勻加熱： 常規加熱，為提高加熱速度，就需要升高加熱溫度，容易產生外焦內生現象。微波加熱時，物體各部分通常都能均勻滲透電磁波，產生熱量，因此均勻性大大改善，內外溫度基本一樣。
3、節能高效： 在微波加熱中，微波能只能被加熱物體自身吸引而生熱，加熱室壁和加熱室內的空氣及相應的容器都不會發熱，所以熱效應，對生產環境也明顯改善。
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