好氧發酵常見的方式主要有場地堆肥發酵、立式發酵罐發酵和臥式滾筒發酵反應器發酵。其中利用臥式好氧發酵反應器發酵具有發酵效率高、分解速度快、周期短，物料發酵均勻，透氣性好、占地面積小、運行能耗低等優點。
好氧發酵主要的目的就是為了有效地實現有機糞污的無害化和減量化。根據好氧發酵特性，維持系統高溫可以使系統具有更高的發酵效率，使病菌能夠得到更充分的滅殺，無害化也更為；但高溫好氧發酵過程會產生大量的高溫高濕的臭氣，反應器需要將發酵過程中產生的廢氣進行收集和無害化治理，還需要通過排風將含有大量水蒸氣的臭氣及時排出，同時為發酵物料引入新鮮氧氣，從而促進物料持續的發酵并將發酵物料中的水分帶走，實現有效的減量化。目前，為了維持高溫好氧發酵的高溫環境，大多是依托于外源加熱，如熱水、導熱油或者鼓熱風等方式，運行能耗高，經濟性比較差。
隨著廢棄物排量不斷增大，堆肥技術越來越得到重視。相應的堆肥設備發展迅速，好氧堆肥反應器系統具有堆體溫度高，發酵時間短，有機物分解，有效防止病原菌的傳播和異味散發的優點。 因此，大型的好氧堆肥反應器系統在廢棄物處理中的應用越來越廣泛。
反應器滾筒的軸線呈水平或是與水平方向有一定的傾角，工作時滾筒在驅動裝置帶動下以設定速度繞軸線轉動物料在滾筒轉動和筒內抄動裝置作用下 被反復抄起升高跌落使物料的溫度水分均勻化同時獲得氧氣完成堆肥反應。除反應器系統還包括風機，通氣管路和尾氣處理裝置等。直徑一般為~4m 長度4-40m 轉速為6分一轉，筒體傾斜放置，沿旋轉方向提升的物料靠自身重力下落時逐漸向筒體出口一端移動，并從出口排出，系統可24小時連續操作，發酵時間為4~7 天。
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