瓜子黃楊的葉為光亮的革質，通常呈比較寬闊的橢圓形倒卵形，或者卵狀的橢圓形或長圓形，大多數葉片的長度在1.5-3.5厘米之間，寬為0.8-2厘米，先端較圓或較鈍，常有比較小的凹口，不尖銳，比較接近“瓜子"的形態，于是得名瓜子黃楊。
瓜子黃楊的花期為3月，頭狀花序為腋生，開花時花朵十分密集，經常一簇簇長在枝條的頂端，瓜子黃楊的花朵為黃綠色，沒有花瓣只有花蕊，但花比較小看起來并不明顯，只是安靜默默地開放。瓜子黃楊的果實為長度6-10毫米左右接近球形的蒴果，果期5-6月
瓜子黃楊耐陰喜光喜濕潤也耐旱，可以抵抗一個月左右陰雨天氣，但經受不了長時間的積水，長期處在蔭蔽環境中雖然葉片可以保持翠綠，但易導致枝條徒長或變弱。并且瓜子黃楊也擁有“變色"效應，秋季光照充分并進入休眠狀態后，葉片可從綠轉為紅色。因為瓜子黃楊的生長速度比較緩慢，俗稱“千年不大黃楊木"，在民間又得了個有趣的別稱--千年矮。
雖然“矮"但卻成就了瓜子黃楊的一大優勢，那就是分蘗性，耐修剪，易成型，并且瓜子黃楊可以渾然天成虬枝曲干，其奇特多姿的樹形，成為樹樁盆景的優良素材，是的盆栽品種。
在很多地區也十分喜愛選取瓜子黃楊來作為盆栽造型，裝點景觀。春季嫩葉初生，滿樹嫩綠的黃楊盆景，生機勃勃十分賞心悅目
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