為了使潔凈實驗室室內保持所需要的溫度、濕度、風速、壓力和潔凈度等參數，的方法是向室內不斷送入一定量經過處理的空氣，以消除潔凈室內外各種熱濕干擾及塵埃污染。為獲得送入潔凈室具有一定狀態的空氣，就需要一整套設備對空氣進行處理，并不斷送入室內，又不斷從室內排出一部分來，這一整套設備就構成了潔凈空調系統。1、空調系統應能夠對潔凈實驗室的凈化等級參數進行綜合控制潔凈空調系統分為集中式與分散式，集中式潔凈空調系統又稱空調，所有空氣處理設備(風機、粗、中、高效過濾器、加熱器、冷卻器、加濕器、除濕器和制冷機組等)都集中在空調機房內，通過輸送管道將精密控制處理后的空氣分配給空氣末端裝置，送到凈化實驗室里，以不同換氣次數和氣流形式來實現潔凈實驗室不同的潔凈級別。 這種空調系統熱源和冷源集中，對空氣的基本參數的調整易于實現，它處理空氣量大，也便于凈化參數控制，運行可靠，是目前大型集群式凈化實驗室的方式。 分散式潔凈室空調系統大多局限于局部實驗室需要凈化處理的情況，把單獨的空調處理系統安置在凈化實驗室或凈化實驗室的不同區域，在出風口通過各類過濾器和凈化裝置如風機過濾單元(FFU)對空氣進行凈化處理，每一個末端處理系統可以單獨對空氣參數進行調節，也可以實現對不同凈化實驗室凈化等級的控制。