現代制備色譜柱具有以下特征: （1） 柱長短、內徑大、呈圓餅狀。常用制備柱的柱長與分析柱相仿,一般為20 ～50cm ,,而內徑為10 ～1 000mm ,因此可以在較大的流速下不致產生很高的柱壓降,從而獲得高的產率。（2） 填料顆粒小,分布窄。采用直徑為10 ～20μm 的細顆粒,孔徑及粒度分布均很窄的多孔球形或非球形填料替代傳統大顆粒（40 ～200μm） 、寬分布的無定形填料填充制備柱,因而具有高得多的柱效,通常每米的塔板數在20 000以上,有的甚至可達到與分析柱相仿的柱效。（3） 流速高。流動相的線速一般在5 ～10cm/min ,以便提高產率,降低生產成本。
制備色譜柱Φ50mm以內，可以使用預裝柱，但是Φ50mm以上就必須使用軸向壓縮柱。軸向壓縮柱可分為靜態和動態軸向壓縮柱。一般Φ50－Φ100mm可以使用靜態或動態軸向壓縮柱，但是Φ100m以上制備柱必須使用動態軸向壓縮柱。