高效液相色譜儀使用需要做好清潔工作，如果儀器內部有灰塵、雜物進入，則有可能導致儀器原件出現旁路問題，進而會器對微弱電流的識別，造成儀器靈敏度和穩定性下降，運行過程中噪音過大，基線出現漂移。在色譜儀內部，檢測器和微電流放大器接線需要具備高性能絕緣性，以保證其檢測數據不受干擾。同時，儀器還需要做好防潮工作，如果空氣濕度過大.則容易導致表面原件電阻下降,儀器運行穩定性受到影響。因此儀器需要放置于干燥通風、周邊無腐蝕性氣體的環境中，儀器關鍵元件需要放置干燥硅膠,以保持周邊環境干燥，提高儀器運轉性能。
可以通過調整流動相比例、調整流動相PH值、更換其他牌子的液相色譜柱和增加色譜柱的長度等方法嘗試解決。
1.調整流動相比例：檢測使用的液相色譜柱有較高的理論塔板數，能提供更好的分離度，從而對可能存在的雜質有更大的分離的可能性；可以通過同時調整流速、減少進樣量來進行比例的調整；
2.調整流動相的pH值：流動相pH值的變化可以改變樣品的保留時間和分辨率；流動相pH值的變化甚至可以改變一些樣品的出峰順序；流動相pH值的變化可以改變樣品的峰高，即即，峰型可調；
3.更換其他牌子的色譜柱：使用其他廠商出產的色譜柱進行使用測試；
4.增加液相色譜柱的長度。
