啤酒中除了酒精和二氧化碳，還含有蛋白質，碳水化物，以及其他上百種有機物。而每當啤酒接上啤酒扎啤機系統后，酵母和細菌也會隨著啤酒進入并吸附在管路和設備上。此外，啤酒中還會有礦物質的析出，也會殘留在管路和部件上。如果不進行適當的清洗，這些殘留物將迅速地影響啤酒的風味，并大幅降低扎啤供應的效率和品質。

因而，即便是一套全新安裝的啤酒扎啤機系統，只需短短幾天，產生的殘留物就會附著在啤酒經過的管路和設備中。

進行適當的清洗，就需要我們采用適當的清潔劑和正確的清洗流程，對扎啤管路進行定期清潔，從而有效防止有機物和礦物質在扎啤系統中殘留，并殺滅破壞啤酒風味的微生物。扎啤清洗流程需要合理制定，并且嚴格執行，這樣才能確保扎啤系統故障率降到，供應出新鮮、美味的啤酒。

新的啤酒扎啤機系統在使用前也需要用化學清洗劑進行清洗，并用冷水沖凈殘留后，才能打酒。這么做，可以去除可能存在的污染物，并把管路內的氧氣趕走。在接上酒桶之前，還需要用二氧化碳將所有管路的空氣頂走，避免氧氣被壓入新開的酒桶內。

啤酒扎啤機系統的設計應當遵循“供酒管路盡可能短”的原則，以避免操作困難，節約清潔成本。隨著供酒管路的加長，酒液大量起沫和其他打酒的問題也會增多，這會造成大量酒損浪費。此外，更長的管路還會增加設備的負擔，增加設備維修和更換的成本。