凈水處理一般常用的膜過濾方式有全量過濾方式和錯流方式2種。
全量過濾方式是全量過濾供給水的全量方式，是與一般砂濾相同的方式。與砂過濾一樣必須定期地進行清洗。但是錯流是向膜面平行流動，這樣可以抑制膜供給水中的懸濁物質和膠體在膜里面的堆積。
過濾方式與原水水質、濾膜的材料和分離性能、濾膜組件構造、清洗方法等有很大的關系，因此必須選擇適合處理條件的方法。
從成本來看，全量過濾方式不需要錯流方式那樣的平行流，因此所需動力少。錯流方式膜面流速越高在膜面上就越不容易堆積附著物質，從防止膜污染的角度來看，必須實現高膜面流速。但是，膜面流速越高增加運行成本，因此必須全面考慮處理水量和清洗效果的關系，設計經濟的膜面流速。
