發酵工程(Fermentation Engineering) 屬于生物技術的范疇, 生物技術又稱生物工藝學, 最初是由一位匈牙利工程師 Karl.Ereky于 1917 年提出的。 當時他提出的生物技術這一名詞的涵義是指甜菜作為飼料進行大規模養豬, 即利用生物將原料轉化為產品。

現在的生物技術的定義為: 生物技術是應用自然科學及工程學原理依靠生物催化劑的作用將物料進行加工以提供產品或社會服務的技術。 因此, 生物技術是一門綜合性多學科技術, 他涉及的基礎學科有生物學、 化學和工程學。 下圖為生物技術與基礎學科關系的示意圖。 它逐漸成為與生物學、 生物化學、 化學工程等多學科密切相關的綜合性邊緣學科。
現代生物技術作為一門新興的高科技術產業, 它的生命力在于他對社會經濟和發展的各個方面都帶來了極大沖擊和影響。