冷凍研磨儀在僅僅1-3分鐘內即可快速高效的粉碎多達2X96個樣品。粉碎是通過將預處理的樣品放入研磨容器內（如不銹鋼罐或離心管/適配器）研磨罐或適配器在水平方向上進行圓弧式徑向擺動，在高頻擺動作用下，研磨罐內的小球高速撞擊樣品來完成的。當使用很多小球時（如玻璃球），生物細胞就可以被破碎了。球與球之間的摩擦撞擊作用可以有效導致細胞的破碎。
樣品的低溫冷凍研磨粉碎在實驗室中的已成為普遍性的應用，特別是某些對于動物的研究課題實驗，往往需要先將動物組織進行研磨前處理，而手動研磨不容易達到預期的效果，不能獲取到合格的檢測樣品，就需冷凍研磨儀來操作了。
在實驗操作開始前，需將緩沖液行低溫預冷操作，然后再準備若干的冰塊以備用，之后再使用濃度較高的乙醇對鑷子、剪子等研磨工具進行消毒處理，如果的運行過程中需要對樣品進行RNA等成分的提取，還需再次使用酒精對鑷子和剪刀等物品進行再次的消毒殺菌，以盡可能的消毒RNA酶
再準備好2ml的離心管置于冰塊上做低溫預處理，并在其加入適量的PBS緩沖液，再將待研磨的組織樣本從零下80℃的冰箱內取出，置于冰上，使用滅菌后的鑷子和剪刀，將其樣本切成小塊，然后再將其放入加好相應液體的離心管中備用。
準備好冷凍研磨儀，將其離心管放到研磨設備的適配器內，設置對樣品的研磨參數，開啟設備的運轉，待設備停止運轉后便可取出研磨的試樣，以備后續的實驗應用。
冷凍研磨儀對樣品處理的三大關鍵要素：高效率研磨一批處理多達192個樣品；低溫研磨溫度可自定義調節；低溫保護樣品成分不破壞樣品成分。
