注射用水系統醫用蒸餾水設備是由水處理設備、存儲設備、分配泵及管網等組成的。制水系統存在著由原水及制水系統外部原因所致的外部污染的可能，而原水的污染則是制水系統主要的外部污染源。美國藥典、歐洲藥典及中國藥典均明確要求制藥用水的原水至少要達到飲用水的質量標準。通常我們建議原水采用醫用純化。在標準中以“細菌總數”表示，我國規定的細菌總數限度為100個/ml，這說明符合飲用水標準的原水中也存在著微生物污染，而危及制水系統的污染菌主要是革蘭陰性菌。其他如貯罐的排氣口無保護措施或使用了劣質氣體過濾器，水從污染了的出口倒流等也可導致外部污染。 制水系統的日常管理包括運行、維修，它對驗證及正常使用關系，所以應建立監控、預修計劃，以確保水系統的運行始終出于受控狀態。這些內容包括：
①制水系統的操作、維修規程；
②關鍵的水質參數和運行參數的監測計劃，包括關鍵儀表的校準；
③定期消毒/滅菌計劃；
④水處理設備的預防性維修計劃；
⑤關鍵水處理設備（包括主要的零部件）、管路分配系統及運行條件便更的管理方法。
