傳統(tǒng)的菌落計數(shù)器使用時，是將計數(shù)筆連接到主機上，打開電源開關，將培養(yǎng)皿放在白光板上，打開白光燈，用計數(shù)筆觸動計數(shù)，LED顯示屏顯示所計數(shù)量；計數(shù)完成可用計數(shù)筆在稿紙上暫記總數(shù)，重新開關電源，LED顯示屏自動歸零，二次計數(shù)與稿紙上一次總數(shù)比較，數(shù)量相同可得較準確的結果。同時，按照細菌計數(shù)檢驗規(guī)程規(guī)定，一只培養(yǎng)皿中細菌生長數(shù)超過300個時，應將檢驗樣品稀釋重作，以保證計數(shù)的準確性，所以，一般的菌落計數(shù)器儀器顯示計為三位數(shù)。
多功能是由數(shù)字處理芯片、集成電路，以及顯示屏、按鍵組成，與各種顯微鏡配合使用，由微電腦進行自動分類計數(shù)的數(shù)字化產品，能對骨多功能髓細胞、外周血細胞、小巨核細胞進行全面的分類計數(shù)并自動計算出各項指標，能對細胞化學染色后的積分進行計算，并兼有常用的四則運算。