微波的熱效應(yīng)主要起快速升溫殺菌作用：而非熱效應(yīng)則使用微生物體內(nèi)蛋白質(zhì)和生理活性物質(zhì)發(fā)生變異，而喪失活力或死亡。因此，微波殺菌溫度低于常規(guī)方法，一般比較，常規(guī)方法殺菌溫度要在100-120度以上，時(shí)間要在十幾分鐘至幾十分鐘，而微波殺菌溫度僅在70至90度，時(shí)間約為幾分鐘（例如：豆制品細(xì)菌總數(shù)6-7萬左右，經(jīng)過微波殺菌以后細(xì)菌總數(shù)只有6千以下，大腸菌群小于30，時(shí)間十五分鐘左右達(dá)到食品殺菌的要求）