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常見的發酵罐分為固體發酵罐和液體發酵罐。發酵罐根據容積和用途不同，分為種子罐（菌種發酵罐）和發酵罐。發酵罐根據需氧類型的不同又分為通風式發酵罐和厭氧發酵罐。

發酵罐的罐體尺寸從50L—5000L全系列。一般發酵罐的高徑比為1.7-2.5之間，高徑比大有利于傳熱和溶氧，攪拌剪切力大。發酵罐的攪拌裝置包括機械攪拌和非機械攪拌。通風發酵的攪拌裝置包括電動機、傳動裝置、攪拌軸、軸密封裝置和攪拌槳。機械攪拌的目的是迅速分散氣泡和混合加入物料。一個攪拌槳要同時達到這兩個目的，有時是矛盾的。例如，達到混合功能需要大直徑的攪拌器和采用低轉速運轉，而提高分散氣泡效果則需要多葉片、小直徑和大的轉速。電動機輸入功率決定于攪拌槳形式和其他發酵罐部件。發酵罐內常安裝4塊擋板以增加混合、傳熱和傳質效率。擋板之寬度為發酵罐直徑的10%～12%，擋板越寬則混合效果越好。在好氣深層發酵罐中，二手三聯微生物發酵罐來自無菌空氣系統的壓縮空氣通過空氣分布器射入發酵罐內，分布器有單孔管式和多孔管式。安裝方式各異，一般安裝在下面一檔攪拌器的下方，但都要注意防止氣孔被發酵液中的菌體或固體顆粒堵塞。有的空氣分布器帶有放水結構，使放罐后沒有發酵液殘留在管子里。通氣速度以滿足微生物發酵的需要為準，在使溶氧在臨界氧深度之上。它決定于系統的設計和操作。空氣流速的上限速度是空氣能有效地被攪拌槳分散，這和攪拌槳形式和轉速有關。