用作植物生長刺激素及分析試劑。3-吲哚乙酸以及3-吲哚乙醛、3-吲哚乙腈、抗壞血酸等茁長素類物質在自然界天然存在，3-吲哚乙酸在植物體內生物合成的前體是。茁長素的基本作用在于調節植物的生長，不僅能促進生長，而且具有抑制生長和器官建成的作用。生長素在植物細胞內不僅以游離狀態存在，還可以與生物高分子等牢固結合的束縛型茁長素存在，也有與特殊物質形成結合物的茁長素，例如吲哚乙酰基天、吲哚乙酸阿戊糖和吲哚乙酰葡萄糖等。
吲哚乙酸廣譜多用途，但因它在植物體內外易降解而未成常用商品。早期用它誘導番茄單性結實和坐果，在盛花期以3000mg/L藥液浸泡花，形成無籽番茄果，提高坐果率；促進插枝生根它是應用 早的一個方面。以100~1000mg/L藥液浸泡插枝的基部，可促進茶樹、膠樹、柞樹、水杉、胡椒等作物不定根的形成，加快營養繁殖速度。1~10mg/L吲哚乙酸和10mg/L惡霉靈混用，促進水稻秧苗生根。25~400mg/L藥液噴灑一次菊花（在9小時光周期下），可抑制花芽的出現，延遲開花。生長在長日照下揪海棠以10-5mol/L濃度噴灑一次，可增加雌花。處理甜菜種子可促進發芽，增加塊根產量和含糖量。
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