分子蒸餾是一種在高真空下操作的蒸餾方法，這時蒸氣分子的平均自由程大于蒸發表面與冷凝表面之間的距離，從而可利用料液中各組分蒸發速率的差異，對液體混合物進行分離。
分子蒸餾是一種特殊的液--液分離技術，它不同于傳統蒸餾依靠沸點差分離原理，而是靠不同物質分子運動平均自由程的差別實現分離。
隨著科學的進步，現在許多的生產不需要人工進行操作，許多的技術都被應用到我們的生產過程中，這是不但可以便利于我們的生產工作，這是一種技術發展的體現。其中短程分子蒸餾就可以解決一些傳統蒸餾技術不能解決的問題。
它可以改進普通蒸餾環境的操作難處。由于分子蒸餾只要冷熱兩個面之間，到達溫度差時，可以在不同溫度下進行分離。而傳統的蒸餾需要嚴格的按照，物料的沸點，進行相關的操作，不但費時、費力，而且難掌握。
傳統的蒸餾在高溫下，會出現鼓泡、沸騰的情況，這些問題分子蒸餾也可以解決。它可以在液膜表面自由的蒸發，因為其操作壓力低，所以也不會出現類似的一些問題。
它可以應用于各物質，這也是普通的蒸餾所不能達到的。普通的蒸餾需要掌握液相和氣相之間的平衡動態，而它則改變了這一情況，受熱時間短，只要十幾秒的時間，在實際的應用操作過程中，可以省時、省力，增加生產效率。
日常生活中，人們可以采用短程分子蒸餾對沙棘油進行進一步提純，乙酯化的沙棘油中的不飽和脂肪酸由于分子運動自由程較短沿著加熱面流下來，與原油分離從而獲得產品油。
