水的衛生細菌學檢驗主要包括兩個常規項目：(1)水中細菌總數的測定;(2)水中總大腸菌群的測定。

　　對水樣進行細菌學檢驗時，必須嚴格注意一下細節：

　　1)水樣必須收集在經過預先滅菌處理的采樣瓶中，并保證在采集、運送、保存過程中不受污染。

　　2)水樣在采集后應盡可能迅速檢驗，若需推遲檢驗，應貯藏在0-10℃的溫度下(通常是貯藏于4℃的冰箱)，保持時間不得超過4h。

　　3)所取水樣必須能夠代表該水質。

　　4)自來水、深井水等清潔水，可直接用于檢驗;水源水及生活污水一般要稀釋后才能用于檢驗。稀釋倍數視水的污染程度而定。

　　5)細菌培養時需要在同等條件下作空白對照培養。

　　水中細菌總數的測定——平板計數法

　　水中的細菌種類繁多，各種細菌的生理特性不一致。沒有任何一種單獨的培養基能滿足水中所有細菌的營養要求，但大多數細菌在營養瓊脂培養基上生長良好。因此，水中細菌總數是指1mL水樣在營養瓊脂培養基上于37℃培養24h后生長的細菌菌落總數，所得結果只包括一群能在營養瓊脂上發育的嗜中溫的需氧的細菌菌落總數。在37℃下培養的細菌，可代表在人的體溫下可繁殖的腐生細菌，其衛生意義相對較大。但水中細菌總數主要是作為水被細菌污染程度的指標，不能說明污染的來源，因此必須結合大腸菌群數來判斷水污染的來源和安全程度。

　　采用平板計數技術測定水中的細菌總數，是將水樣接種于營養瓊脂培養基上，于37℃培養24h，在培養基表面會生長出肉眼可見的菌落。每個獨立的菌落可代表培養前水中的一個細菌。通過菌落計數和計算，報告每毫升原水樣中的細菌總數。鑒于水中的細菌細胞是以單個、成雙、成鏈或成堆的形式存在，因而在營養瓊脂平板上出現的菌落可以來源于細胞塊也可來源于單個細胞，故而平板上生長的菌落數應以單位容量中的菌落形成單位數(Colony Forming Units CFU)報告，即CFU/mL。